Misiolari jesuita, ekialdeko Asian egindako ebanjelizazio lanagatik egin zen ospetsu eta Indietako Apostolu ezizena jarri zioten. Xabierko Gazteluan jaio zen 1506an, gurasoak Joan Jaso –orduan Nafarroako Errege Kontseiluko presidentea– eta Maria Azpilkueta –oso familia noblekoa, Martin Azpilkueta doktore ospetsuaren familia berekoa– izanik. Nafarroa inbaditzen ari ziren Gaztelako tropen aurka borrokatu behar izan zuten Migel eta Joanek, anaia nagusiek, aitak Joan Albretekoa erregeari Irunberriko gotorlekura ihes egiten laguntzen zion bitartean. Frantziskok bere etxean bertan bizi izan zuen Nafarroak erresuma independente gisa izandako azken arnasa.
